Các quy trình điều hành hệ thống đảm bảo chất lượng bên trong của Phòng Quản lý khoa học và Sau đại học:
1. Quy trình lập kế hoạch giảng dạy
2. Quy trình xây dựng chương trình đào tạo trình độ thạc sĩ
3. Quy trình cập nhật tổ chức đánh giá chương trình đào tạo trình độ thạc sĩ
4. Quy trình đăng ký và điều chỉnh học phần
5. Quy trình làm luận văn thạc sĩ
6. Quy trình tổ chức thi kết thúc học phần chương trình đào tạo thạc sĩ
7. Quy trình thực hiện cho sinh viên chuyển trường
8. Quy trình lên kế hoạch thực hiện xếp thời khóa biểu
9. Quy trình báo nghỉ, báo bù, mượn phòng
10. Quy trình thống kê giờ giảng
11. Quy trình thanh toán giờ giảng
12. Quy trình hợp đồng mời giảng và quản lý giảng viên mời giảng
13. Quy trình xét tốt nghiệp và cấp phát bằng
14. Quy trình theo dõi và quản lý đề tài nghiên cứu khoa học
15. Thủ tục trình tự thực hiện hỗ trợ đổi mới công nghệ, chuyển giao công nghệ
16. Thủ tục, trình tự hỗ trợ đăng ký bản quyền sở hữu trí tuệ